山西省城乡居民医保信息系统与原新农合信息系统尚未有效整合，影响医保报销效率 2016 年1月， ，部分地区新农合信息系统关停；二是运城、临汾、长治3个市新农合家庭账户收支无法及时导入城乡居民医保系统。

但截至2017年底，人社部门难以及时准确掌握新农合家庭账户情况；三是7个地市的1300个乡镇卫生院、乡镇医保定点机构尚未开发好软件接口，影响医保报销效率，报销时需再次人工录入，山西省有10个地市仍未移交历史数据。

国务院要求各地对城镇居民基本医疗保险和新农合医疗保险进行整合。